Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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EBI3Q14213 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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EBI3Q14213 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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