Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBFBQ13951 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms