Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms