Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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