Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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NAE1Q13564 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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NAE1Q13564 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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NAE1Q13564 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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NAE1Q13564 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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NAE1Q13564 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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NAE1Q13564 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NAE1Q13564 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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NAE1Q13564 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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