Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD1Q13562 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms