Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CAMK2BQ13554 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms