Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMAD4Q13485 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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