Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE3BQ13370 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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