Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CBX3Q13185 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CBX3Q13185 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CBX3Q13185 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CBX3Q13185 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CBX3Q13185 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CBX3Q13185 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CBX3Q13185 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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