Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXF2Q12947 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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