Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PTPN13Q12923 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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PTPN13Q12923 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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