Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
STX4Q12846 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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STX4Q12846 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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STX4Q12846 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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STX4Q12846 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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STX4Q12846 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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STX4Q12846 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
STX4Q12846 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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STX4Q12846 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
STX4Q12846 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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