Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TROQ12816 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TROQ12816 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TROQ12816 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TROQ12816 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TROQ12816 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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