Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBRQ0VD83 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms