Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms