Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms