Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CFHR1Q03591 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms