Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNFRSF17Q02223 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFRSF17Q02223 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms