Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BNC1Q01954 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms