Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEX3Q00994 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms