Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SKOR1P84550 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms