Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTA1P68133 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACTA1P68133 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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