Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms