Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO1P63165 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms