Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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