Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VBP1P61758 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VBP1P61758 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VBP1P61758 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VBP1P61758 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms