Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BRCA2P51587 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms