Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms