Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NESP48681 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NESP48681 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NESP48681 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NESP48681 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NESP48681 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NESP48681 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NESP48681 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NESP48681 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NESP48681 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NESP48681 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NESP48681 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms