Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms