Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FDFT1P37268 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms