Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LTBRP36941 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LTBRP36941 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LTBRP36941 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms