Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms