Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA3P26006 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms