Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMA4P25789 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms