Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms