Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TAF1P21675 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TAF1P21675 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF1P21675 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms