Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NF1P21359 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NF1P21359 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NF1P21359 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NF1P21359 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NF1P21359 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NF1P21359 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NF1P21359 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NF1P21359 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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