Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms