Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms