Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACADSP16219 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACADSP16219 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACADSP16219 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms