Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DSPP15924 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DSPP15924 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DSPP15924 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DSPP15924 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DSPP15924 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms