Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DMDP11532 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DMDP11532 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DMDP11532 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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