Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHGAP10645 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHGAP10645 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CHGAP10645 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CHGAP10645 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHGAP10645 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHGAP10645 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms