Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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