Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NIPSNAP2O75323 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms