Protein–RNA interactions for Protein: O75112

LDB3, LIM domain-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB3O75112 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LDB3O75112 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms