Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
XRCC2O43543 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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