Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HOXA3O43365 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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HOXA3O43365 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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